第143章 生化分析器
分子尺度的细胞模型,是各所大学的生物实验室一直努力建立和完善的东西。
二百年前的二十一世纪,大约2034年前后的时候,神州大地的大学与研究生,拥有的分子级别生物模型的数量,是〇。
生物力学实验室的存在历史不超过七十年。即使是在大神州,细胞模型做得最早和最丰富的,也绝非生物力学实验室。
不过,他们实验室的海鞘模型,崭崭新,足够精细。因为年轻,所以先进。不仅仅是分子尺度的细胞模型,而且是分子级别的生物体整体模型。
模型构建者兰泽吹嘘,他可以利用附带的计算工具,对海鞘细胞进行任意的功能修改。只要用生物化学规则计算出相应的dna序列嵌入到原来的染色体中,就可以达到修改可遗传的效果。
现有的做dna设计的实验室,做到的事情,也就是利用基因库拼装新细胞的dna。做得好的几家都是基因库积累比较强大的。
“你这个厉害了嘛!”仙女这么说来着。
老罗教授专门召集实验室全体人员,包括忙的、闲的、打杂的、日常进来溜达的,开了个会。
他对全世界宣布,本实验室的海鞘数学模型暨海鞘数据动态库可以用了。欢迎同行来,要么膜拜要么砸场子。
这个会开得,门都不关。
仙女等散会才进来找兰泽。
兰泽身边正围着一帮学弟学妹,个个眼中闪着膜拜的星光。以前在体育总馆玩模拟器,他经常被膜拜,所以挺习惯的。
“还可以吧。”兰泽不带谦虚的。
“可以修改细胞的话,如果我们不知道功能对应的基因是什么,怎么改呢?”勤学好问的混实验室的大四小师妹问。
“算嘛。”
“算什么?”师妹一脸萌萌哒。
“用功能蛋白质计算dna呀。”兰泽理所当然地说。
“哎?可以编程了?”仙女恍然大悟。
兰泽沉思半晌,“你这个想法好啊。”
仙女一说,他才意识到,利用分子间作用力反推计算dna序列这件事,根本上就是编程嘛!
用电脑玩编程,他熟得很。虽然dna序列他没玩过,但道理大致相通,规则略有不同而已。至于同一条染色体上两端靠共振通讯,dna大长链各种拧麻花式调节功能,这些生物大分子的特色,正是和电脑不完全一样,才有意思。不是吗?
他们实验室的楼上,以及大东研发城的研究所,都有人在做dna编程设计。不少实验室可以在现有真核微生物的基础上,做一些特殊功能的修改。至于病毒设计,已经有少量的成熟商业应用了。
dna和氨基酸的对照表,早在二十世纪就被人摸清楚了。光靠这个完全没法设计出生物来。正如知道铁是铁,离发明订书机还差着八百里呢。
基因库的大部分内容,实际上是关于各种条件下,细胞内的活动如何控制、如何操作的。以所谓“操纵元”为单位。大部分操纵元的部件,并不按顺序排列在一起。有时候甚至可以跨越好几条染色体。正是因为这样的复杂性,基因库中每一项新的功能单元,分析需要十分细致。基因库在历史上的积累是十分缓慢的。
没有基因库,dna编程就没有零件。
兰泽忽然觉得,他可以再多做一点东西。比如说,写个生化分析器代替基因库?
计算一下生命相关的各种调控方式,各种功能性大分子,应该是可以做到的吧?
想到了,他就问道:
“你们几个,有没有时间,帮我做几个验证实验?”
“兰师兄,要做什么实验?”一群师弟妹踊跃扑了上来,“我来,我有空。”
“别急,实验够大家分的。”兰泽从容地说。
“我能帮上什么忙吗?”仙女笑着问。
兰泽想了想:“我想看看现有的生化分析算法长什么样。”
仙女替他筛选了一些常用而又不涉密级的生化分析算法。
兰泽回到宿舍里收到后,躺在床上慢慢看完,时间就挺晚的了。
他发现一件事,这些算法挺陈旧的。
物理学和数学并不是几百年没有进展的学科。但是这些算法,都建立在上百年前人类对世界认知的基础上。
作为一个自我感觉数学不错的人,兰泽认为,生化分析算法,他应该自己重写一遍。
现有的算法,并不太适合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽链、核糖链、多肽与核糖结合在一起的复杂长链,往往具有打了结又绕在一起的结构——这些结构是很多生物功能的基础。但是现有的算法,有的处理方式和算术没什么本质区别,有的则根本不顾这些复杂结构。
原因很简单:术业有专攻。数学、物理和化学本来就是不同的领域。
主流算法久经考验,一般情况下已经足够简便好用,也用不着太先进。但用来处理生物微观活动,这些算法的效率和精度都不够。
而被国家研究部门珍藏的,有密级的生化分析算法,会是什么样,兰泽暂时也看不到。
他琢磨完了这些现有的算法,直接合上眼睛,打算睡觉来着。眼角好像闪过一抹蓝光。
于是他举起手环看了一眼,发现有延时消息。
他设置过的,张荷大学姐联络,手环闪蓝光。
“小朋友,想不想去游泳?”张大学姐的声音特别有质感。不清脆,但是说不出的好听。
这条消息,按照大学姐的设置,本该在他醒来以后,才震动提醒他查看手环,现在提前查看到了。
“想。”兰泽轻轻地回答了一个字。
“哎?几点了还不睡?”
“睡不着。”兰泽眼睛都闭上了。闭着眼说瞎话。
“睡不着,我们聊会儿天?”
“不要。”
“嗯?”
“得了。什么时候游泳?”兰泽迷迷糊糊地问。
“游泳啊……”
“快说时间。”兰泽困得不行,又特别想去游泳。不管能不能游,哪怕看看水都是好的。
“你……明天……天气……站点……风……”兰泽完全没有听清楚张荷到底说了什么。
二百年前的二十一世纪,大约2034年前后的时候,神州大地的大学与研究生,拥有的分子级别生物模型的数量,是〇。
生物力学实验室的存在历史不超过七十年。即使是在大神州,细胞模型做得最早和最丰富的,也绝非生物力学实验室。
不过,他们实验室的海鞘模型,崭崭新,足够精细。因为年轻,所以先进。不仅仅是分子尺度的细胞模型,而且是分子级别的生物体整体模型。
模型构建者兰泽吹嘘,他可以利用附带的计算工具,对海鞘细胞进行任意的功能修改。只要用生物化学规则计算出相应的dna序列嵌入到原来的染色体中,就可以达到修改可遗传的效果。
现有的做dna设计的实验室,做到的事情,也就是利用基因库拼装新细胞的dna。做得好的几家都是基因库积累比较强大的。
“你这个厉害了嘛!”仙女这么说来着。
老罗教授专门召集实验室全体人员,包括忙的、闲的、打杂的、日常进来溜达的,开了个会。
他对全世界宣布,本实验室的海鞘数学模型暨海鞘数据动态库可以用了。欢迎同行来,要么膜拜要么砸场子。
这个会开得,门都不关。
仙女等散会才进来找兰泽。
兰泽身边正围着一帮学弟学妹,个个眼中闪着膜拜的星光。以前在体育总馆玩模拟器,他经常被膜拜,所以挺习惯的。
“还可以吧。”兰泽不带谦虚的。
“可以修改细胞的话,如果我们不知道功能对应的基因是什么,怎么改呢?”勤学好问的混实验室的大四小师妹问。
“算嘛。”
“算什么?”师妹一脸萌萌哒。
“用功能蛋白质计算dna呀。”兰泽理所当然地说。
“哎?可以编程了?”仙女恍然大悟。
兰泽沉思半晌,“你这个想法好啊。”
仙女一说,他才意识到,利用分子间作用力反推计算dna序列这件事,根本上就是编程嘛!
用电脑玩编程,他熟得很。虽然dna序列他没玩过,但道理大致相通,规则略有不同而已。至于同一条染色体上两端靠共振通讯,dna大长链各种拧麻花式调节功能,这些生物大分子的特色,正是和电脑不完全一样,才有意思。不是吗?
他们实验室的楼上,以及大东研发城的研究所,都有人在做dna编程设计。不少实验室可以在现有真核微生物的基础上,做一些特殊功能的修改。至于病毒设计,已经有少量的成熟商业应用了。
dna和氨基酸的对照表,早在二十世纪就被人摸清楚了。光靠这个完全没法设计出生物来。正如知道铁是铁,离发明订书机还差着八百里呢。
基因库的大部分内容,实际上是关于各种条件下,细胞内的活动如何控制、如何操作的。以所谓“操纵元”为单位。大部分操纵元的部件,并不按顺序排列在一起。有时候甚至可以跨越好几条染色体。正是因为这样的复杂性,基因库中每一项新的功能单元,分析需要十分细致。基因库在历史上的积累是十分缓慢的。
没有基因库,dna编程就没有零件。
兰泽忽然觉得,他可以再多做一点东西。比如说,写个生化分析器代替基因库?
计算一下生命相关的各种调控方式,各种功能性大分子,应该是可以做到的吧?
想到了,他就问道:
“你们几个,有没有时间,帮我做几个验证实验?”
“兰师兄,要做什么实验?”一群师弟妹踊跃扑了上来,“我来,我有空。”
“别急,实验够大家分的。”兰泽从容地说。
“我能帮上什么忙吗?”仙女笑着问。
兰泽想了想:“我想看看现有的生化分析算法长什么样。”
仙女替他筛选了一些常用而又不涉密级的生化分析算法。
兰泽回到宿舍里收到后,躺在床上慢慢看完,时间就挺晚的了。
他发现一件事,这些算法挺陈旧的。
物理学和数学并不是几百年没有进展的学科。但是这些算法,都建立在上百年前人类对世界认知的基础上。
作为一个自我感觉数学不错的人,兰泽认为,生化分析算法,他应该自己重写一遍。
现有的算法,并不太适合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽链、核糖链、多肽与核糖结合在一起的复杂长链,往往具有打了结又绕在一起的结构——这些结构是很多生物功能的基础。但是现有的算法,有的处理方式和算术没什么本质区别,有的则根本不顾这些复杂结构。
原因很简单:术业有专攻。数学、物理和化学本来就是不同的领域。
主流算法久经考验,一般情况下已经足够简便好用,也用不着太先进。但用来处理生物微观活动,这些算法的效率和精度都不够。
而被国家研究部门珍藏的,有密级的生化分析算法,会是什么样,兰泽暂时也看不到。
他琢磨完了这些现有的算法,直接合上眼睛,打算睡觉来着。眼角好像闪过一抹蓝光。
于是他举起手环看了一眼,发现有延时消息。
他设置过的,张荷大学姐联络,手环闪蓝光。
“小朋友,想不想去游泳?”张大学姐的声音特别有质感。不清脆,但是说不出的好听。
这条消息,按照大学姐的设置,本该在他醒来以后,才震动提醒他查看手环,现在提前查看到了。
“想。”兰泽轻轻地回答了一个字。
“哎?几点了还不睡?”
“睡不着。”兰泽眼睛都闭上了。闭着眼说瞎话。
“睡不着,我们聊会儿天?”
“不要。”
“嗯?”
“得了。什么时候游泳?”兰泽迷迷糊糊地问。
“游泳啊……”
“快说时间。”兰泽困得不行,又特别想去游泳。不管能不能游,哪怕看看水都是好的。
“你……明天……天气……站点……风……”兰泽完全没有听清楚张荷到底说了什么。